云南佛手苗总状花序有花达12朵，有时兼有腋生单花；花两性，有单性花趋向，则雌蕊退化；花瓣5片，长1.5-2厘米；雄蕊30-50枚；花柱粗长，柱头头状。子房在花住脱落后即行分裂，在果的发育过程中成为手指状肉条。

云南佛手苗果实手指状肉条形，重可达2000克，果皮淡黄色，粗糙，果皮甚厚，难剥离，内皮白色或略淡黄色，棉质，松软，瓢囊10-15瓣，果肉无色，近于透明或淡乳黄色，爽脆，味酸或略甜，有香气；种子小，平滑，子叶乳白色，多或单胚。通常无种子。花期4-5月，果期10-11月。

佛手的香气比香橼浓，久置更香。药用佛手因产区不同而名称有别。产浙江的称金佛手（主产地在金华市），产福建的称闽佛手，产广东和广西的称广佛手，产四川和云南的，分别称川佛手与云佛手或统称川佛手。云南还有一些栽培品种，它的果肉有酸的也有甜的，果皮近于平滑至甚粗糙，果萼薄或增厚呈肉质，种子平滑或略具钝棱。